Gunstig klima kombinert med særegne og varierte naturtyper gir grunnlag for en spesiell og variert fuglefauna med mellom 60 og 70 arter som årlig hekker på øya. Det er et yrende fugleliv av sangere og andre spurvefugler i krattsamfunn og skog. Hauksangeren har her en av sine vestligste utposter i Europa og kanskje det siste hekkestedet i Norge. Pirolen opptrer årlig som det eneste sted i Norge. Pa sørspissen ligger Skadden sjø-fuglreservat. Jomfruland Fuglestasjon ble opprettet i 1969 og er blant landets mest aktive. Det store fugletrekket på øya danner en naturlig ramme for ringmerking, registreringer og overvåking av fuglelivet. 307 arter er påtruffet pr. 2001. Du kan støtte stasjonen ved a kjøpe rapporter og salgsartikler ved henvendelse til fuglestasjonen.